Jurusan Pendidikan Geografi merupakan salah satu jurusan di lingkungan perguruan tinggi pendidikan guru (PTPG) Tondano yang dibuka pada tahun 1955. Pergolakan di Sulawesi Utara menyebabkan kegiatan kampus terhenti dan staf pengajar yang sebagian besar adalah orang asing, warga Negara Belanda kembali ke negerinya. Hal ini menyebabkan Jurusan Pendidikan Geografi tidak dapat dibuka kembali setelah pemulihan keamanan di Sulawesi Utara dan perkuliahan dipindahkan ke Manado.

Pada tahun 1969, Jurusan Pendidikan Geografi dibuka kembali pada Fakultas Keguruan Ilmu Sosial IKIP Manado berdasarkan keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan. Pada bulan September 1984, Program Studi Pendidikan Geografi dibuka berdasarkan SK Direktur Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 060/Dikti/1984 Tanggal 31 Juli 1984.